1、2号轨道线
具体走向
根据方案，1号线：总长63.9公里，利用漳泉肖既有铁路线约8公里。其中主线42.9公里，由福厦高铁泉州站经董埔路—漳泉肖铁路—刺桐路向南延伸过晋江，跨福厦高速公路，沿和平路经晋江机场，沿石泉路—香江路—石湖大道向北延伸至蚶江，与3号线衔接换乘。支线起于主线子芳路站，沿省道308向龙湖金井方向延伸，长21公里。
其主要功能：加强环湾主要生活组团（中心城区、晋江、石狮）之间的联系；加强生活组团与主要对外交通枢纽（高铁泉州站、晋江机场、城际铁晋江站）的联系；利用支线加强对晋南地区与强中心的联系。
敷设方式设想：考虑到泉州站景观要求，暂按地下线考虑，具体敷设方式结合火车站综合交通规划实施。漳泉肖铁路段，利用铁路线位可采用高架线，也可采用地面，环境保护区域考虑，暂按地面线。刺桐路段，因沿线人口密集，宜采用地下线。线路下穿晋江后，在江南、晋江及石狮均采用高架方式。在东湖街、津淮街，分别利用侨乡体育中心、刺桐公园的空间，设置与4号线、2号线的联络线，以方便车辆统一调配使用、资源共享预留条件。
2号线：漳泉肖铁路南安站—漳泉肖铁路洛阳站，总长50.7公里，由漳泉肖铁路南安站，经南安市中心区、霞美、浮桥、江南沿笋江大桥跨晋江，沿新门街—涂门街—津淮街—泉秀东街—东滨大道至东海新行政中心，跨洛阳江，沿洛沙大道至漳泉肖铁路洛阳站。远景延伸至安溪，其中安溪延伸线不在研究范围内。
主要功能：连接南安市中心区、泉州中心城区与东海行政中心各组团之间的联系；加强洛阳江两侧的联系，远期连接安溪，加强安溪与中心组团的联系。
敷设方式设想：南安片区及江南片区，采用高架形式，泉州老城区采用地下线，东海及百崎、洛秀均采用高架线。