6月6日下午，上海铁路局与南京港（集团）有限公司、南京地下铁道有限责任公司在宁签署战略合作协议，全面加强铁路与港口、地铁联运合作与交流，更好地为南京及长三角区域经济社会发展提供运输保障。南京市市长季建业出席仪式并讲话，副市长罗群、陆冰以及上海铁路局、南京港（集团）有限公司、南京地下铁道有限责任公司领导参加仪式。
根据上海铁路局与南京港（集团）有限公司签订的战略合作协议，双方将重点加强港铁合作，大力发展水铁联运，促进港铁联运量持续增长。其中，新生圩港区在2012年铁路到发量450万吨的基础上，保持30%以上的年增量，到2015年力争达到1000万吨以上。上海铁路局将南京港作为战略装车点和重点客户，进一步优化运输组织方案，在运力安排和运输组织上给予优先保供。
双方将共同推进新生圩和龙潭等港区的铁路硬件设施改造，提高站场周转能力。双方牵头建立港口、煤矿、电厂、铁路四方联动机制，提高运输效率，形成路、港、矿、厂一体化的大运输格局。同时，双方将共同推进南京港“十二五”发展规划实施，力争南京港集团货物吞吐量突破1.4亿吨。
根据上海铁路局和南京地下铁道有限责任公司此次签署的战略合作协议，双方将立足于长远发展，在维修业务与技术服务、客运组织与运输管理、前期规划与设计方案、工程建设与物资供应、文化建设与员工培训等方面进行长期密切合作。同时，双方建立战略合作协调沟通机制，不断提升与拓展双方合作关系，促进共同发展。
有关专家认为，上海铁路局与南京港（集团）有限公司、南京地下铁道有限责任公司同属交通运输行业，此次签署战略合作协议，将有利于更好地发挥各自资源优势，实现运输资源有效整合和利用，提高运输效率，降低物流成本，扩大上海、江苏等东部沿海地区对安徽、江西等沿江省份的辐射效应，对于南京加快建设航运与综合枢纽名城和长江国际航运物流中心，助推长三角乃至沿江区域经济社会发展具有重要意义。