修建地铁可不便宜，据测算，地铁1号线一期工程成本为5.9亿元/公里，地铁2号线一期工程成本为5.93亿元/公里，整个工程总投资达268.45亿元。其中，工程资本金112.89亿元，占总投资的42.05%，由郑州市财政从土地有偿使用收入和城市基础设施配套费等专项资金中安排，其余155.56亿元，通过银行贷款方式解决。
在工程建设的2008年~2015年，郑州市城建专项资金收入预计为668亿元，扣除同期重大项目建设投资303.5亿元，郑州市财政平均每年需要安排资本金14.11亿元，约占郑州市财政收入的3%，有足够的资金用于地铁建设。
地铁工程财务分析认为，初步估算两条线路从开始运营到2020年，将累计亏损15.22亿元，加上还本付息等，需要郑州市资金支出177亿元。这些费用计划利用地铁经营收益、附属资源开发及土地开发收益弥补，不足部分由郑州市财政提供补贴。